Spark之Stage详解【专题】
问题导读1.什么是spark stage?
2.stage如何划分?
3.Spark 多个Stage执行是串行执行的么?
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什么是spark stage
什么是spark stage,这里没有明确的概念,我们可以从下面的内容中来提取它的含义。
1.在DAGScheduler中,会将每个job划分成多个stage,每个stage会创建一批task并且计算task的最佳位置,一个task对应一个partition。DAGScheduler的stage划分算法如下:它会从触发action操作的那个RDD开始往前倒推,首先会为最后一个RDD创建一个stage,然后往前倒推的时候,如果发现对某个RDD是宽依赖,那么就会将宽依赖的那个RDD创建一个新的stage,那个RDD就是新的stage的最后一个RDD。然后依次类推,继续往前倒推,根据窄依赖或者宽依赖进行stage的划分,直到所有的RDD全部遍历完成为止。
创建完task之后,stage会将一批task用TaskSet来封装,提交给TaskScheduler进行分配,最后发送到Executor执行。
2.一个Job可以有一个或者多个Stage,Stage划分的依据就是宽依赖,产生宽依赖的算子:reduceByKey、groupByKey等等
3.Spark在运行时会把Stage包装成任务提交,有父Stage的Spark会先提交父Stage。
4.Spark Application在遇到action算子时,SparkContext会生成Job,并将构成DAG图将给DAG Scheduler解析成Stage。
上面都是说了相关Stage与job相关的内容,这里说下个人理解。
这有点符合美国人的思维,美国人会把一个工作细分为每个步骤。
所以spark job,所以老美就细分为每个stage。如果接触过hive,其实他也是有stage的。
如何划分stage
对于stage有了了解,接着该如何划分stage。
下面例子可参考
1.从hdfs中读取文件后,创建 RDD 对象
2.DAGScheduler模块介入运算,计算RDD之间的依赖关系。RDD之间的依赖关系就形成了DAG
3.每一个JOB被分为多个Stage,划分Stage的一个主要依据是当前计算因子的输入是否是确定的,如果是则将其分在同一个Stage,避免多个Stage之间的消息传递开销。以下面一个按 A-Z 首字母分类,查找相同首字母下不同姓名总个数的例子来看一下 RDD 是如何运行起来的。
注:mapValues(function) 原RDD中的Key保持不变,与新的Value一起组成新的RDD中的元素。因此,该函数只适用于元素为KV对的RDD。步骤 1 :创建 RDD 上面的例子除去最后一个 collect 是个动作,不会创建 RDD 之外,前面四个转换都会创建出新的 RDD 。因此第一步就是创建好所有 RDD( 内部的五项信息 ) 。
步骤 2 :创建执行计划 Spark 会尽可能地管道化,并基于是否要重新组织数据来划分阶段 (stage) ,例如本例中的 groupBy() 转换就会将整个执行计划划分成两阶段执行。最终会产生一个 DAG(directed acyclic graph ,有向无环图 ) 作为逻辑执行计划。步骤 3 :调度任务将各阶段划分成不同的任务(task),每个任务都是数据和计算的合体。在进行下一阶段前,当前阶段的所有任务都要执行完成。因为下一阶段的第一个转换一定是重新组织数据的,所以必须等当前阶段所有结果数据都计算出来了才能继续。 +
个人总结:划分stage的依据是数据是否需要进行重组。
下面从源码角度来分析:
源码Stage划分
前面提到,对于JobSubmitted事件,我们通过调用DAGScheduler的handleJobSubmitted()方法来处理。那么我们先来看下代码:
// 处理Job提交的函数
private def handleJobSubmitted(jobId: Int,
finalRDD: RDD,
func: (TaskContext, Iterator) => _,
partitions: Array,
callSite: CallSite,
listener: JobListener,
properties: Properties) {
var finalStage: ResultStage = null
// 利用最后一个RDD(finalRDD),创建最后的stage对象:finalStage
try {
// New stage creation may throw an exception if, for example, jobs are run on a
// HadoopRDD whose underlying HDFS files have been deleted.
// 根据最后一个RDD获取最后的stage
finalStage = newResultStage(finalRDD, func, partitions, jobId, callSite)
} catch {
case e: Exception =>
logWarning("Creating new stage failed due to exception - job: " + jobId, e)
listener.jobFailed(e)
return
}
// 创建一个ActiveJob对象
val job = new ActiveJob(jobId, finalStage, callSite, listener, properties)
// 清除RDD分区位置缓存
// private val cacheLocs = new HashMap]]
clearCacheLocs()
// 调用logInfo()方法记录日志信息
logInfo("Got job %s (%s) with %d output partitions".format(
job.jobId, callSite.shortForm, partitions.length))
logInfo("Final stage: " + finalStage + " (" + finalStage.name + ")")
logInfo("Parents of final stage: " + finalStage.parents)
logInfo("Missing parents: " + getMissingParentStages(finalStage))
val jobSubmissionTime = clock.getTimeMillis()
// 将jobId-->ActiveJob的对应关系添加到HashMap类型的数据结构jobIdToActiveJob中去
jobIdToActiveJob(jobId) = job
// 将ActiveJob添加到HashSet类型的数据结构activeJobs中去
activeJobs += job
finalStage.setActiveJob(job)
//2 获取stageIds列表
// jobIdToStageIds存储的是jobId--stageIds的对应关系
// stageIds为HashSet类型的
// jobIdToStageIds在上面newResultStage过程中已被处理
val stageIds = jobIdToStageIds(jobId).toArray
// stageIdToStage存储的是stageId-->Stage的对应关系
val stageInfos = stageIds.flatMap(id => stageIdToStage.get(id).map(_.latestInfo))
listenerBus.post(
SparkListenerJobStart(job.jobId, jobSubmissionTime, stageInfos, properties))
// 提交最后一个stage
submitStage(finalStage)
// 提交其他正在等待的stage
submitWaitingStages()
}
这个handleJobSubmitted()方法一共做了这么几件事:
第一,调用newResultStage()方法,生成Stage,包括最后一个Stage:ResultStage和前面的Parent Stage:ShuffleMapStage;
第二,创建一个ActiveJob对象job;
第三,清除RDD分区位置缓存;
第四,调用logInfo()方法记录日志信息;
第五,维护各种数据对应关系涉及到的数据结构:
(1)将jobId-->ActiveJob的对应关系添加到HashMap类型的数据结构jobIdToActiveJob中去;
(2)将ActiveJob添加到HashSet类型的数据结构activeJobs中去;
第六,提交Stage;
下面,除了提交Stage留在第三阶段外,我们挨个分析第二阶段的每一步。
首先是调用newResultStage()方法,生成Stage,包括最后一个Stage:ResultStage和前面的Parent Stage:ShuffleMapStage。代码如下:
/**
* Create a ResultStage associated with the provided jobId.
* 用提供的jobId创建一个ResultStage
*/
private def newResultStage(
rdd: RDD,
func: (TaskContext, Iterator) => _,
partitions: Array,
jobId: Int,
callSite: CallSite): ResultStage = {
// 根据fianl RDD获取parent stage及id,这个id为ResultStage的stageId
val (parentStages: List, id: Int) = getParentStagesAndId(rdd, jobId)
// 创建一个ResultStage,即为整个Job的finalStage
// 参数:id为stage的id,rdd为stage中最后一个rdd,func为在分区上执行的函数操作,
// partitions为rdd中可以执行操作的分区,parentStages为该stage的父stages,jobId为该stage
val stage = new ResultStage(id, rdd, func, partitions, parentStages, jobId, callSite)
// 将stage加入到stageIdToStage中
stageIdToStage(id) = stage
// 更新数据结构jobIdToStageIds
updateJobIdStageIdMaps(jobId, stage)
// 返回stage
stage
}
首先,根据fianl RDD获取parent stages及id,这个id为ResultStage的stageId;
其次,创建一个ResultStage,即为整个Job的finalStage;
然后,将stage加入到数据结构stageIdToStage中;
接着,更新数据结构jobIdToStageIds;
最后,返回这个ResultStage。
我们一步步来看。首先调用getParentStagesAndId()方法,根据fianl RDD获取parent stages及id,这个id为ResultStage的stageId。代码如下:
/**
* Helper function to eliminate some code re-use when creating new stages.
*/
private def getParentStagesAndId(rdd: RDD, firstJobId: Int): (List, Int) = {
// 获取parent stages
val parentStages = getParentStages(rdd, firstJobId)
// 获取下一个stageId,为AtomicInteger类型,getAndIncrement()能保证原子操作
val id = nextStageId.getAndIncrement()
// 返回parentStages和id
(parentStages, id)
}
这个id即为下一个stageId,通过AtomicInteger类型的getAndIncrement()获得,能够保证原子性。继续分析getParentStages()方法,通过它来获取final RDD的parent stage。代码如下:
/**
* Get or create the list of parent stages for a given RDD.The new Stages will be created with
* the provided firstJobId.
*/
private def getParentStages(rdd: RDD, firstJobId: Int): List = {
// 用HashSet存储parents stage
val parents = new HashSet
// 用HashSet存储已经被访问过的RDD
val visited = new HashSet]
// We are manually maintaining a stack here to prevent StackOverflowError
// caused by recursively visiting
// 存储需要被处理的RDD。Stack中得RDD都需要被处理
val waitingForVisit = new Stack]
// 定义一个visit函数,根据传入的RDD,如果之前没有处理过,标记为已处理,循环此RDD的依赖关系dependencies
// 如果是ShuffleDependency,获取其parents;如果不是,则说明为同一stage,并压入Stack:waitingForVisit顶部
def visit(r: RDD) {
if (!visited(r)) {// visited中没有的话
// 将RDD r加入到visited,表示已经处理过了
visited += r
// Kind of ugly: need to register RDDs with the cache here since
// we can't do it in its constructor because # of partitions is unknown
// 循环Rdd r的依赖关系
for (dep <- r.dependencies) {
dep match {
case shufDep: ShuffleDependency =>
// 如果是ShuffleDependency,获取其parents,添加到parents中去
parents += getShuffleMapStage(shufDep, firstJobId)
case _ =>
// 否则,属于同一个stage,压入Stack顶部,后续再递归处理
waitingForVisit.push(dep.rdd)
}
}
}
}
// 将rdd压入Stack顶部
waitingForVisit.push(rdd)
// 循环waitingForVisit,弹出每个rdd
while (waitingForVisit.nonEmpty) {
// 调用visit()方法,处理每个rdd
visit(waitingForVisit.pop())
}
// 返回得到的parents列表
parents.toList
}
getParentStages()方法在其内部定义了如下数据结构:
parents:用HashSet存储parents stages,即finalRDD的所有parent stages,也就是ShuffleMapStage;
visited:用HashSet存储已经被访问过的RDD,在RDD被处理前先存入该HashSet,保证存储在里面的RDD将不会被重复处理;
waitingForVisit:存储需要被处理的RDD。Stack中得RDD都需要被处理。
getParentStages()方法在其内部还定义了一个visit()方法,传入一个RDD,如果之前没有处理过,标记为已处理,并循环此RDD的依赖关系dependencies,如果是ShuffleDependency,调用getShuffleMapStage()方法获取其parent stage;如果不是,则说明为同一stage,并压入Stack:waitingForVisit顶部,等待后续通过visit()方法处理。所以,getParentStages()方法从finalRDD开始,逐渐往上查找,如果是窄依赖,证明在同一个Stage中,继续往上查找,如果是宽依赖,通过getShuffleMapStage()方法获取其parent stage,就能得到整个Job中所有的parent stages,也就是ShuffleMapStage。
接下来,我们看下getShuffleMapStage()方法的实现。代码如下:
/**
* Get or create a shuffle map stage for the given shuffle dependency's map side.
* 针对给定的shuffle dependency的map端,获取或者创建一个ShuffleMapStage
*/
private def getShuffleMapStage(
shuffleDep: ShuffleDependency,
firstJobId: Int): ShuffleMapStage = {
// 从数据结构shuffleToMapStage中根据shuffleId获取,如果有直接返回,否则
// 获取ShuffleDependency中的rdd,调用getAncestorShuffleDependencies()方法,
// 循环每个parent,调用newOrUsedShuffleStage()方法,创建一个新的ShuffleMapStage,
// 并加入到数据结构shuffleToMapStage中去
//
// 它的定义为:private val shuffleToMapStage = new HashMap
shuffleToMapStage.get(shuffleDep.shuffleId) match {
case Some(stage) => stage // 有则直接返回
case None => // 没有
// We are going to register ancestor shuffle dependencies
// 调用getAncestorShuffleDependencies()方法,传入ShuffleDependency中的rdd
// 发现还没有在shuffleToMapStage中注册的祖先shuffle dependencies
getAncestorShuffleDependencies(shuffleDep.rdd).foreach { dep =>
// 并循环返回的parents,调用newOrUsedShuffleStage()方法,创建一个新的ShuffleMapStage,
// 并加入到数据结构shuffleToMapStage中去
shuffleToMapStage(dep.shuffleId) = newOrUsedShuffleStage(dep, firstJobId)
}
// Then register current shuffleDep
// 最后注册当前shuffleDep,并加入到数据结构shuffleToMapStage中,返回stage
val stage = newOrUsedShuffleStage(shuffleDep, firstJobId)
shuffleToMapStage(shuffleDep.shuffleId) = stage
stage
}
}
通过代码我们可以发现,它和getParentStages()方法的代码风格非常相似。在其内部也定义了三个数据结构:
parents:存放parents的栈,即Stack,用于存放入参RDD的在shuffleToMapStage中未注册过的祖先shuffle dependencies;
visited:存放已经处理过的RDD的哈希表,即HashSet;
waitingForVisit:存放等待被处理的RDD的栈,即Stack;
定义了一个visit()方法,入参为RDD,针对传入的RDD,如果之前没有处理过则标记为已处理,并循环RDD的所有依赖,如果是如果是ShuffleDependency,并且其依赖的shuffleId在shuffleToMapStage中没有,添加到parents中,否则直接跳过,最后无论为何种Dependency,都将该dependence的rdd压入waitingForVisit栈顶部,等待后续处理。
接下来,我们再看下newOrUsedShuffleStage()方法,其代码如下:
/**
* Create a shuffle map Stage for the given RDD.The stage will also be associated with the
* provided firstJobId.If a stage for the shuffleId existed previously so that the shuffleId is
* present in the MapOutputTracker, then the number and location of available outputs are
* recovered from the MapOutputTracker
*
* 为给定的RDD创建一个ShuffleStage
*/
private def newOrUsedShuffleStage(
shuffleDep: ShuffleDependency,
firstJobId: Int): ShuffleMapStage = {
// 从shuffleDep中获取RDD
val rdd = shuffleDep.rdd
// 获取RDD的分区个数,即未来的task数目
val numTasks = rdd.partitions.length
// 构造一个ShuffleMapStage实例
val stage = newShuffleMapStage(rdd, numTasks, shuffleDep, firstJobId, rdd.creationSite)
if (mapOutputTracker.containsShuffle(shuffleDep.shuffleId)) {
// 如果mapOutputTracker中存在
// 根据shuffleId从mapOutputTracker中获取序列化的多个MapOutputStatus对象
val serLocs = mapOutputTracker.getSerializedMapOutputStatuses(shuffleDep.shuffleId)
// 反序列化
val locs = MapOutputTracker.deserializeMapStatuses(serLocs)
// 循环
(0 until locs.length).foreach { i =>
if (locs(i) ne null) {
// locs(i) will be null if missing
// 将
stage.addOutputLoc(i, locs(i))
}
}
} else {
// 如果mapOutputTracker中不存在,注册一个
// Kind of ugly: need to register RDDs with the cache and map output tracker here
// since we can't do it in the RDD constructor because # of partitions is unknown
logInfo("Registering RDD " + rdd.id + " (" + rdd.getCreationSite + ")")
// 注册的内容为
// 1、根据shuffleDep获取的shuffleId;
// 2、rdd中分区的个数
mapOutputTracker.registerShuffle(shuffleDep.shuffleId, rdd.partitions.length)
}
stage
}
这个方法的主要完成了以下两件事:
1、构造一个ShuffleMapStage实例stage;
2、判断是否在mapOutputTracker中存在:
(1)如果不存在,调用mapOutputTracker的registerShuffle()方法注册一个,注册的内容为根据shuffleDep获取的shuffleId和rdd中分区的个数;
(2)如果存在,根据shuffleId从mapOutputTracker中获取序列化的多个MapOutputStatus对象,反序列化后循环,逐个添加到stage中。
紧接着,看下newShuffleMapStage()方法,其代码如下:
/**
* Create a ShuffleMapStage as part of the (re)-creation of a shuffle map stage in
* newOrUsedShuffleStage.The stage will be associated with the provided firstJobId.
* Production of shuffle map stages should always use newOrUsedShuffleStage, not
* newShuffleMapStage directly.
*/
private def newShuffleMapStage(
rdd: RDD,
numTasks: Int,
shuffleDep: ShuffleDependency,
firstJobId: Int,
callSite: CallSite): ShuffleMapStage = {
// 获得parentStages和下一个stageId
val (parentStages: List, id: Int) = getParentStagesAndId(rdd, firstJobId)
// 创建一个ShuffleMapStage
val stage: ShuffleMapStage = new ShuffleMapStage(id, rdd, numTasks, parentStages,
firstJobId, callSite, shuffleDep)
// 将stage加入到数据结构stageIdToStage
stageIdToStage(id) = stage
updateJobIdStageIdMaps(firstJobId, stage)
stage
}
可以发现,这个方法也调用了getParentStagesAndId()方法,这样,就形成了一个递归,按照RDD的依赖关系,由后往前,逐渐生成Stage。代码剩余的部分就是创建一个ShuffleMapStage,并将stage加入到数据结构stageIdToStage,以及调用updateJobIdStageIdMaps()方法更新相关数据结构。这个updateJobIdStageIdMaps()方法留待下面分析。
下面,简单看下mapOutputTracker注册的代码。
// 注册shuffle
def registerShuffle(shuffleId: Int, numMaps: Int) {
// 将shuffleId、numMaps大小和MapStatus类型的Array数组的映射关系,放入mapStatuses中
// mapStatuses为TimeStampedHashMap]类型的数据结构
if (mapStatuses.put(shuffleId, new Array(numMaps)).isDefined) {
throw new IllegalArgumentException("Shuffle ID " + shuffleId + " registered twice")
}
}
很简单,将shuffleId、numMaps大小和MapStatus类型的Array数组的映射关系,放入mapStatuses中,mapStatuses为TimeStampedHashMap]类型的数据结构。
经历了这多又长又大篇幅的叙述,现在返回newResultStage()方法,在通过getParentStagesAndId()方法获取parent stages及其result stage的id后,紧接着创建一个ResultStage,并将stage加入到stageIdToStage中,最后在调用updateJobIdStageIdMaps()更新数据结构jobIdToStageIds后,返回stage。
下面,简单看下updateJobIdStageIdMaps()方法。代码如下:
/**
* Registers the given jobId among the jobs that need the given stage and
* all of that stage's ancestors.
*/
private def updateJobIdStageIdMaps(jobId: Int, stage: Stage): Unit = {
// 定义一个函数updateJobIdStageIdMapsList()
def updateJobIdStageIdMapsList(stages: List) {
if (stages.nonEmpty) {
// 获取列表头元素
val s = stages.head
// 将jobId添加到Stage的jobIds中
s.jobIds += jobId
// 更新jobIdToStageIds,将jobId与stageIds的对应关系添加进去
jobIdToStageIds.getOrElseUpdate(jobId, new HashSet()) += s.id
val parents: List = getParentStages(s.rdd, jobId)
val parentsWithoutThisJobId = parents.filter { ! _.jobIds.contains(jobId) }
updateJobIdStageIdMapsList(parentsWithoutThisJobId ++ stages.tail)
}
}
// 调用函数updateJobIdStageIdMapsList()
updateJobIdStageIdMapsList(List(stage))
}
这个方法的实现比较简单,在其内部定义了一个函数updateJobIdStageIdMapsList(),首选传入result stage,将jobId添加到stage的jobIds中,更新jobIdToStageIds,将jobId与stageIds的对应关系添加进去,然后根据给定stage的RDD获取其parent stages,过滤出不包含此JobId的parents stages,再递归调用updateJobIdStageIdMapsList()方法,直到全部stage都处理完。
至此,Stage划分大体流程已分析完毕
spark stage的划分,我们可能感觉了解的不够,更多还需我们多找资料,多用心。下面我们继续,spark Stage是什么,是如何划分的,那么spark stage是串行执行吗?
Spark 多个Stage执行是串行执行的么?
看如下的代码:
这里的话,我们构建了两个输入(input1,input2),input2带有一个reduceByKey,所以会产生一次Shuffle,接着进行Join,会产生第二次Shuffle(值得注意的是,join 不一定产生新的Stage,我通过强制变更join后的分区数让其发生Shuffle ,然后进行Stage的切分)。
所以这里一共有两次Shuffle,产生了四个Stage。 下图是Spark UI上呈现的。那这四个Stage的执行顺序是什么呢?
再次看Spark UI上的截图:
我们仔细分析下我们看到现象:
首先我们看到 Stage0,Stage 1 是同时提交的。
Stage0 只有两条记录,并且设置了两个Partition,所以一次性就能执行完,也就是3s就完成了。
Stage1 有四个分区,六条记录,记录数最多的分区是两条,也就是需要执行10秒,如果完全能并行执行,也就是最多10s。但是这里消耗了13秒,为什么呢?点击这个13秒进去看看:
我们看到有两个task 延迟了3秒后才并行执行的。 根据上面的代码,我们只有四颗核供Spark使用,Stage0 里的两个任务因为正在运行,所以Stage1 只能运行两个任务,等Stage0 运行完成后,Stage1剩下的两个任务才接着运行。
之后Stage2 是在Stage1 执行完成之后才开始执行,而Stage3是在Stage2 执行完成才开始执行。
现在我们可以得出结论了:
Stage 可以并行执行的
存在依赖的Stage 必须在依赖的Stage执行完成后才能执行下一个Stage
Stage的并行度取决于资源数
我么也可以从源码的角度解释这个现象:
我们看到如果一个Stage有多个依赖,会深度便利,直到到了根节点,如果有多个根节点,都会通过submitMissingTasks 提交上去运行。当然Spark只是尝试提交你的Tasks,能不能完全并行运行取决于你的资源数了。
这里再贡献一张画了很久的示意图,体现了partition,shuffle,stage,RDD,transformation,action,source 等多个概念。
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Spark之任务调度
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辛苦楼主.每天都默默奉献 谢谢楼主,学习一下,赞~~ 深度理解spark 能够看懂这篇文章的才算懂SPARK
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