问题导读
1、如何理解HDFS读文件过程?
2、怎样对Block列表进行排序?
3、如何 创建FSDataInputStream流对象?
在使用Java读取一个文件系统中的一个文件时,我们会首先构造一个DataInputStream对象,然后就能够从文件中读取数据。对于存储在HDFS上的文件,也对应着类似的工具类,但是底层的实现逻辑却是非常不同的。我们先从使用DFSClient.DFSDataInputStream类来读取HDFS上一个文件的一段代码来看,如下所示:
package org.shirdrn.hadoop.hdfs;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStreamReader;
import org.apache.hadoop.conf.Configuration;
import org.apache.hadoop.fs.FSDataInputStream;
import org.apache.hadoop.fs.FileSystem;
import org.apache.hadoop.fs.Path;
public class HdfsFileReader {
public static void main(String[] args) {
String file = "hdfs://hadoop-cluster-m:8020/data/logs/basis_user_behavior/201405071237_10_10_1_73.log";
Path path = new Path(file);
Configuration conf = new Configuration();
FileSystem fs;
FSDataInputStream in;
BufferedReader reader = null;
try {
fs = FileSystem.get(conf);
in = fs.open(path); // 打开文件path,返回一个FSDataInputStream流对象
reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(in));
String line = null;
while((line = reader.readLine()) != null) { // 读取文件行内容
System.out.println("Record: " + line);
}
} catch (IOException e) {
e.printStackTrace();
} finally {
try {
if(reader != null) reader.close();
} catch (IOException e) {
e.printStackTrace();
}
}
}
}
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基于上面代码,我们可以看到,通过一个FileSystem对象可以打开一个Path文件,返回一个FSDataInputStream文件输入流对象,然后从该FSDataInputStream对象就能够读取出文件的内容。所以,我们从FSDataInputStream入手,详细分析从HDFS读取文件内容的过程,在实际地读取物理数据块之前,首先要获取到文件对应的Block列表元数据信息,整体流程如下图所示:
下面,详细说明整个流程:
创建FSDataInputStream流对象
从一个Path路径对象,能够获取到一个FileSystem对象,然后通过调用FileSystem的open方法打开一个文件流:
public FSDataInputStream open(Path f) throws IOException {
return open(f, getConf().getInt("io.file.buffer.size", 4096));
} 复制代码
由于FileSystem是抽象类,将具体的打开操作留给具体子类实现,例如FTPFileSystem、HarFileSystem、WebHdfsFileSystem等,不同的文件系统具有不同打开文件的行为,我们以DistributedFileSystem为例,open方法实现,代码如下所示:
public FSDataInputStream open(Path f, int bufferSize) throws IOException {
statistics.incrementReadOps(1);
return new DFSClient.DFSDataInputStream(
dfs.open(getPathName(f), bufferSize, verifyChecksum, statistics));
} 复制代码
statistics对象用来收集文件系统操作的统计数据,这里使读取文件操作的计数器加1。然后创建了一个DFSClient.DFSDataInputStream对象,该对象的参数是通过DFSClient dfs客户端对象打开一个这个文件从而返回一个DFSInputStream对象,下面,我们看DFSClient的open方法实现,代码如下所示:
public DFSInputStream open(String src, int buffersize, boolean verifyChecksum,
FileSystem.Statistics stats) throws IOException {
checkOpen();
// Get block info from namenode
return new DFSInputStream(src, buffersize, verifyChecksum);
} 复制代码
checkOpen方法就是检查一个标志位clientRunning,表示当前的dfs客户端对象是否已经创建并初始化,在dfs客户端创建的时候该标志就为true,表示客户端正在运行状态。我们知道,当客户端DFSClient连接到Namenode的时候,实际上是创建了一个到Namenode的RPC连接,Namenode作为Server角色,DFSClient作为Client角色,它们之间建立起Socket连接。只有显式调用DFSClient的close方法时,才会修改clientRunning的值为false,实际上真正地关闭了已经建立的RPC连接。
我们看一下创建DFSInputStream的构造方法实现:
DFSInputStream(String src, int buffersize, boolean verifyChecksum) throws IOException {
this.verifyChecksum = verifyChecksum;
this.buffersize = buffersize;
this.src = src;
prefetchSize = conf.getLong("dfs.read.prefetch.size", prefetchSize);
openInfo();
}
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先设置了几个与读取文件相关的参数值,这里有一个预先读取文件的Block字节数的参数prefetchSize,它的值设置如下:
public static final long DEFAULT_BLOCK_SIZE = DFSConfigKeys.DFS_BLOCK_SIZE_DEFAULT;
public static final long DFS_BLOCK_SIZE_DEFAULT = 64*1024*1024;
defaultBlockSize = conf.getLong("dfs.block.size", DEFAULT_BLOCK_SIZE);
private long prefetchSize = 10 * defaultBlockSize; 复制代码
这个prefetchSize的值默认为10*64*1024*1024=671088640,也就是说,默认预读取一个文件的10个块,即671088640B=640M,如果想要修改这个值,设置dfs.block.size即可覆盖默认值。
然后调用了openInfo方法,从Namenode获取到该打开文件的信息,在openInfo方法中,具体实现如下所示:
synchronized void openInfo() throws IOException {
for (int retries = 3; retries > 0; retries--) {
if (fetchLocatedBlocks()) { // fetch block success. 如果成功获取到待读取文件对应的Block列表,则直接返回
return;
} else {
// Last block location unavailable. When a cluster restarts,
// DNs may not report immediately. At this time partial block
// locations will not be available with NN for getting the length.
// Lets retry a few times to get the length.
DFSClient.LOG.warn("Last block locations unavailable. "
+ "Datanodes might not have reported blocks completely."
+ " Will retry for " + retries + " times");
waitFor(4000);
}
}
throw new IOException("Could not obtain the last block locations.");
}
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上述代码中,有一个for循环用来获取Block列表。如果成功获取到待读取文件的Block列表,则直接返回,否则,最多执行3次等待重试操作(最多花费时间大于12秒)。未能成功读取文件的Block列表信息,是因为Namenode无法获取到文件对应的块列表的信息,当整个集群启动的时候,Datanode会主动向NNamenode上报对应的Block信息,只有Block Report完成之后,Namenode就能够知道组成文件的Block及其所在Datanode列表的信息。openInfo方法方法中调用了fetchLocatedBlocks方法,用来与Namenode进行RPC通信调用,实际获取对应的Block列表,实现代码如下所示:
private boolean fetchLocatedBlocks() throws IOException,
FileNotFoundException {
LocatedBlocks newInfo = callGetBlockLocations(namenode, src, 0, prefetchSize);
if (newInfo == null) {
throw new FileNotFoundException("File does not exist: " + src);
}
if (locatedBlocks != null && !locatedBlocks.isUnderConstruction() && !newInfo.isUnderConstruction()) {
Iterator<LocatedBlock> oldIter = locatedBlocks.getLocatedBlocks().iterator();
Iterator<LocatedBlock> newIter = newInfo.getLocatedBlocks().iterator();
while (oldIter.hasNext() && newIter.hasNext()) {
if (!oldIter.next().getBlock().equals(newIter.next().getBlock())) {
throw new IOException("Blocklist for " + src + " has changed!");
}
}
}
boolean isBlkInfoUpdated = updateBlockInfo(newInfo);
this.locatedBlocks = newInfo;
this.currentNode = null;
return isBlkInfoUpdated;
}
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调用callGetBlockLocations方法,实际上是根据创建RPC连接以后得到的Namenode的代理对象,调用Namenode来获取到指定文件的Block的位置信息(位于哪些Datanode节点上):namenode.getBlockLocations(src, start, length)。调用callGetBlockLocations方法返回一个LocatedBlocks对象,该对象包含了文件长度信息、List blocks列表对象,其中LocatedBlock包含了一个Block的基本信息:
private Block b;
private long offset; // offset of the first byte of the block in the file
private DatanodeInfo[] locs;
private boolean corrupt; 复制代码
有了这些文件的信息(文件长度、文件包含的Block的位置等信息),DFSClient就能够执行后续读取文件数据的操作了,详细过程我们在后面分析说明。
通过Namenode获取文件信息
上面,我们提到获取一个文件的基本信息,是通过Namenode来得到的,这里详细分析Namenode是如何获取到这些文件信息的,实现方法getBlockLocations的代码,如下所示:
public LocatedBlocks getBlockLocations(String src, long offset, long length) throws IOException {
myMetrics.incrNumGetBlockLocations();
return namesystem.getBlockLocations(getClientMachine(), src, offset, length);
} 复制代码
可以看到,Namenode又委托管理HDFS name元数据的FSNamesystem的getBlockLocations方法实现:
LocatedBlocks getBlockLocations(String clientMachine, String src, long offset, long length) throws IOException {
LocatedBlocks blocks = getBlockLocations(src, offset, length, true, true, true);
if (blocks != null) {
//sort the blocks
// In some deployment cases, cluster is with separation of task tracker
// and datanode which means client machines will not always be recognized
// as known data nodes, so here we should try to get node (but not
// datanode only) for locality based sort.
Node client = host2DataNodeMap.getDatanodeByHost(clientMachine);
if (client == null) {
List<String> hosts = new ArrayList<String> (1);
hosts.add(clientMachine);
String rName = dnsToSwitchMapping.resolve(hosts).get(0);
if (rName != null)
client = new NodeBase(clientMachine, rName);
}
DFSUtil.StaleComparator comparator = null;
if (avoidStaleDataNodesForRead) {
comparator = new DFSUtil.StaleComparator(staleInterval);
}
// Note: the last block is also included and sorted
for (LocatedBlock b : blocks.getLocatedBlocks()) {
clusterMap.pseudoSortByDistance(client, b.getLocations());
if (avoidStaleDataNodesForRead) {
Arrays.sort(b.getLocations(), comparator);
}
}
}
return blocks;
}
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跟踪代码,最终会在下面的方法中实现了,如何获取到待读取文件的Block的元数据列表,以及如何取出该文件的各个Block的数据,方法实现代码,这里我做了详细的注释,可以参考,如下所示:
private synchronized LocatedBlocks getBlockLocationsInternal(String src,
long offset,
long length,
int nrBlocksToReturn,
boolean doAccessTime,
boolean needBlockToken)
throws IOException {
INodeFile inode = dir.getFileINode(src); // 获取到与待读取文件相关的inode数据
if (inode == null) {
return null;
}
if (doAccessTime && isAccessTimeSupported()) {
dir.setTimes(src, inode, -1, now(), false);
}
Block[] blocks = inode.getBlocks(); // 获取到文件src所包含的Block的元数据列表信息
if (blocks == null) {
return null;
}
if (blocks.length == 0) { // 获取到文件src的Block数,这里=0,该文件的Block数据还没创建,可能正在创建
return inode.createLocatedBlocks(new ArrayList<LocatedBlock>(blocks.length));
}
List<LocatedBlock> results;
results = new ArrayList<LocatedBlock>(blocks.length);
int curBlk = 0; // 当前Block在Block[] blocks数组中的索引位置
long curPos = 0, blkSize = 0; // curPos表示某个block在文件中的字节偏移量,blkSize为Block的大小(字节数)
int nrBlocks = (blocks[0].getNumBytes() == 0) ? 0 : blocks.length; // 获取到文件src的Block数,实际上一定>0,但是第一个block大小可能为0,这种情况认为nrBlocks=0
for (curBlk = 0; curBlk < nrBlocks; curBlk++) { // 根据前面代码,我们知道offset=0,所以这个循环第一次进来肯定就break出去了(正常的话,blkSize>0,所以我觉得这段代码写的稍微有点晦涩)
blkSize = blocks[curBlk].getNumBytes();
assert blkSize > 0 : "Block of size 0";
if (curPos + blkSize > offset) {
break;
}
curPos += blkSize;
}
if (nrBlocks > 0 && curBlk == nrBlocks) // offset >= end of file, 到这里curBlk=0,如果从文件src的第一个Block的字节数累加计算,知道所有的Block的字节数都累加上了,总字节数仍然<=请求的offset,说明即使到了文件尾部,仍然没有达到offset的值。从前面fetchLocatedBlocks()方法中调用我们知道,offset=0,所以执行该分支表示文件src没有可用的Block数据块可读
return null;
long endOff = offset + length; //
do {
// 获取Block所在位置(Datanode节点)
int numNodes = blocksMap.numNodes(blocks[curBlk]); // 计算文件src中第curBlk个Block存储在哪些Datanode节点上
int numCorruptNodes = countNodes(blocks[curBlk]).corruptReplicas(); // 计算存储文件src中第curBlk个Block但无法读取该Block的Datanode节点数
int numCorruptReplicas = corruptReplicas.numCorruptReplicas(blocks[curBlk]); // 计算FSNamesystem在内存中维护的Block=>Datanode映射的列表中,无法读取该Block的Datanode节点数
if (numCorruptNodes != numCorruptReplicas) {
LOG.warn("Inconsistent number of corrupt replicas for "
+ blocks[curBlk] + "blockMap has " + numCorruptNodes
+ " but corrupt replicas map has " + numCorruptReplicas);
}
DatanodeDescriptor[] machineSet = null; // 下面的if...else用来获取一个Block所在的Datanode节点
boolean blockCorrupt = false;
if (inode.isUnderConstruction() && curBlk == blocks.length - 1
&& blocksMap.numNodes(blocks[curBlk]) == 0) { // 如果文件正在创建,当前blocks[curBlk]还没有创建成功(即没有可用的Datanode可以提供该Block的服务),仍然返回待创建Block所在的Datanode节点列表。数据块是在Datanode上存储的,只要Datanode完成数据块的存储后,通过heartbeat将数据块的信息上报给Namenode后,这些信息才会存储到blocksMap中
// get unfinished block locations
INodeFileUnderConstruction cons = (INodeFileUnderConstruction) inode;
machineSet = cons.getTargets();
blockCorrupt = false;
} else { // 文件已经创建完成
blockCorrupt = (numCorruptNodes == numNodes); // 是否当前的Block在所有Datanode节点上的副本都坏掉,无法提供服务
int numMachineSet = blockCorrupt ? numNodes : (numNodes - numCorruptNodes); // 如果是,则返回所有Datanode节点,否则,只返回可用的Block副本所在的Datanode节点
machineSet = new DatanodeDescriptor[numMachineSet];
if (numMachineSet > 0) { // 获取到当前Block所有副本所在的Datanode节点列表
numNodes = 0;
for (Iterator<DatanodeDescriptor> it = blocksMap.nodeIterator(blocks[curBlk]); it.hasNext();) {
DatanodeDescriptor dn = it.next();
boolean replicaCorrupt = corruptReplicas.isReplicaCorrupt(blocks[curBlk], dn);
if (blockCorrupt || (!blockCorrupt && !replicaCorrupt))
machineSet[numNodes++] = dn;
}
}
}
LocatedBlock b = new LocatedBlock(blocks[curBlk], machineSet, curPos, blockCorrupt); // 创建一个包含Block的元数据对象、所在Datanode节点列表、起始索引位置(字节数)、健康状况的LocatedBlock对象
if (isAccessTokenEnabled && needBlockToken) { // 如果启用Block级的令牌(Token)访问,则为当前用户生成读模式的令牌信息,一同封装到返回的LocatedBlock对象中
b.setBlockToken(accessTokenHandler.generateToken(b.getBlock(), EnumSet.of(BlockTokenSecretManager.AccessMode.READ)));
}
results.add(b); // 收集待返回给读取文件的客户端需要的LocatedBlock列表
curPos += blocks[curBlk].getNumBytes();
curBlk++;
} while (curPos < endOff && curBlk < blocks.length && results.size() < nrBlocksToReturn);
return inode.createLocatedBlocks(results); // 将收集的LocatedBlock列表数据封装到一个LocatedBlocks对象中返回
}
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我们可以看一下,最后的调用inode.createLocatedBlocks(results)生成LocatedBlocks对象的实现,代码如下所示:
LocatedBlocks createLocatedBlocks(List<LocatedBlock> blocks) {
return new LocatedBlocks(computeContentSummary().getLength(), blocks, isUnderConstruction()); // 通过ContentSummary对象获取到文件的长度
} 复制代码
客户端通过RPC调用,获取到了文件对应的Block以及所在Datanode列表的信息,然后就可以根据LocatedBlocks来进一步获取到对应的Block对应的物理数据块。
对Block列表进行排序
我们再回到FSNamesystem类,调用getBlockLocationsInternal方法的getBlockLocations方法中,在返回文件block列表LocatedBlocks之后,会对每一个Block所在的Datanode进行的一个排序,排序的基本规则有如下2点:
Client到Block所在的Datanode的距离最近,这个是通过网络拓扑关系来进行计算,例如Client的网络路径为/dc1/r1/c1,那么路径为/dc1/r1/dn1的Datanode就比路径为/dc1/r2/dn2的距离小,/dc1/r1/dn1对应的Block就会排在前面 从上面一点可以推出,如果Client就是某个Datanode,恰好某个Block的Datanode列表中包括该Datanode,则该Datanode对应的Block排在前面 Block所在的Datanode列表中,如果其中某个Datanode在指定的时间内没有向Namenode发送heartbeat(默认由常量DFSConfigKeys.DFS_NAMENODE_STALE_DATANODE_INTERVAL_DEFAULT定义,默认值为30s),则该Datanode的状态即为STALE,具有该状态的Datanode对应的Block排在后面
基于上述规则排序后,Block列表返回到Client。
Client与Datanode交互更新文件Block列表
我们要回到前面分析的DFSClient.DFSInputStream.fetchLocatedBlocks()方法中,查看在调用该方法之后,是如何执行实际处理逻辑的:
private boolean fetchLocatedBlocks() throws IOException,
FileNotFoundException {
LocatedBlocks newInfo = callGetBlockLocations(namenode, src, 0, prefetchSize); // RPC调用向Namenode获取待读取文件对应的Block及其位置信息LocatedBlocks对象
if (newInfo == null) {
throw new FileNotFoundException("File does not exist: " + src);
}
if (locatedBlocks != null && !locatedBlocks.isUnderConstruction() && !newInfo.isUnderConstruction()) { // 这里面locatedBlocks!=null是和后面调用updateBlockInfo方法返回的状态有关的
Iterator<LocatedBlock> oldIter = locatedBlocks.getLocatedBlocks().iterator();
Iterator<LocatedBlock> newIter = newInfo.getLocatedBlocks().iterator();
while (oldIter.hasNext() && newIter.hasNext()) { // 检查2次获取到的LocatedBlock列表:第2次得到newInfo包含的Block列表,在第2次得到的locatedBlocks中是否发生变化,如果发生了变化,则不允许读取,抛出异常
if (!oldIter.next().getBlock().equals(newIter.next().getBlock())) {
throw new IOException("Blocklist for " + src + " has changed!");
}
}
}
boolean isBlkInfoUpdated = updateBlockInfo(newInfo);
this.locatedBlocks = newInfo;
this.currentNode = null;
return isBlkInfoUpdated;
}
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如果第一次读取该文件时,已经获取到了对应的block列表,缓存在客户端;如果客户端第二次又读取了该文件,仍然获取到一个block列表对象。在两次读取之间,可能存在原文件完全被重写的情况,所以新得到的block列表与原列表完全不同了,存在这种情况,客户端直接抛出IO异常,如果原文件对应的block列表没有变化,则更新客户端缓存的对应block列表信息。
当集群重启的时候(如果允许安全模式下读文件),或者当一个文件正在创建的时候,Datanode向Namenode进行Block Report,这个过程中可能Namenode还没有完全重建好Block到Datanode的映射关系信息,所以即使在这种情况下,仍然会返回对应的正在创建的Block所在的Datanode列表信息,可以从前面getBlockLocationsInternal方法中看到,INode的对应UnderConstruction状态为true。这时,一个Block对应的所有副本中的某些可能还在创建过程中。
上面方法中,调用updateBlockInfo来更新文件的Block元数据列表信息,对于文件的某些Block可能没有创建完成,所以Namenode所保存的关于文件的Block的的元数据信息可能没有及时更新(Datanode可能还没有完成Block的报告),代码实现如下所示:
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我们看一下,在updateBlockInfo方法中,返回false的情况:Client向Namenode发起的RPC请求,已经获取到了组成该文件的数据块的元数据信息列表,但是,文件的最后一个数据块的存储位置信息无法获取到,说明Datanode还没有及时通过block report将数据块的存储位置信息报告给Namenode。通过在openInfo()方法中可以看到,获取文件的block列表信息有3次重试机会,也就是调用updateBlockInfo方法返回false,可以有12秒的时间,等待Datanode向Namenode汇报文件的最后一个块的位置信息,以及Namenode更新内存中保存的文件对应的数据块列表元数据信息。
我们再看一下,在updateBlockInfo方法中,返回true的情况:
文件已经创建完成,文件对应的block列表元数据信息可用 文件正在创建中,但是当前能够读取到的已经完成的最后一个块(非组成文件的最后一个block)的元数据信息可用 文件正在创建中,文件的最后一个block的元数据部分可读:从Namenode无法获取到该block对应的位置信息,这时Client会与Datanode直接进行RPC通信,获取到该文件最后一个block的位置信息
上面Client会与Datanode直接进行RPC通信,获取文件最后一个block的元数据,这时可能由于网络问题等等,无法得到文件最后一个block的元数据,所以也会返回true,也就是说,Client仍然可以读取该文件,只是无法读取到最后一个block的数据。
这样,在Client从Namenode/Datanode获取到的文件的Block列表元数据已经是可用的信息,可以根据这些信息读取到各个Block的物理数据块内容了,准确地说,应该是文件处于打开状态了,已经准备好后续进行的读操作了。