可以下面问题来阅读:
1.为什么hadoop压缩文件能够提高部分计算效率?
2.reduce的数量设多少合适?
3.运行一段时间后hadoop不能stop-all.sh,可能的原因是什么?
1.关于计算过程中的压缩和效率的对比问题
之前曾经介绍过对输入文件采用压缩可以提高部分计算效率。现在作更进一步的说明。
为什么压缩会提高计算速度?这是因为mapreduce计算会将数据文件分散拷贝到所有datanode上,压缩可以减少数据浪费在带宽上的时间,当这些时间大于压缩/解压缩本身的时间时,计算速度就会提高了。
hadoop的压缩除了将输入文件进行压缩外,hadoop本身还可以在计算过程中将map输出以及将reduce输出进行压缩。这种计算当中的压缩又有什么样的效果呢?
测试环境:35台节点的hadoop cluster,单机2 CPU,8 core,8G内存,redhat 2.6.9, 其中namenode和second namenode各一台,namenode和second namenode不作datanode
输入文件大小为2.5G不压缩,records约为3600万条。mapreduce程序分为两个job:
job1:map将record按user字段作key拆分,reduce中作外连接。这样最后reduce输出为87亿records,大小540G
job2:map读入这87亿条数据并输出,reduce进行简单统计,最后的records为2.5亿条,大小16G
计算耗时54min
仅对第二个阶段的map作压缩(第一个阶段的map输出并不大,没有压缩的必要),测试结果:计算耗时39min
可见时间上节约了15min,注意以下参数的不同。
不压缩时:
Local bytes read=1923047905109
Local bytes written=1685607947227
压缩时:
Local bytes read=770579526349
Local bytes written=245469534966
本地读写的的数量大大降低了
至于对reduce输出的压缩,很遗憾经过测试基本没有提高速度的效果。可能是因为第一个job的输出大多数是在本地机上进行map,不经过网络传输的原因。
附:对map输出进行压缩,只需要添加 jobConf.setMapOutputCompressorClass(DefaultCodec.class)
2 关于reduce的数量设置问题
reduce数量究竟多少是适合的。目前测试认为reduce数量约等于cluster中datanode的总cores的一半比较合适,比如 cluster中有32台datanode,每台8 core,那么reduce设置为128速度最快。因为每台机器8 core,4个作map,4个作reduce计算,正好合适。
附小测试:对同一个程序
reduce num=32,reduce time = 6 min
reduce num=128, reduce time = 2 min
reduce num=320, reduce time = 5min
3某次正常运行mapreduce实例时,抛出错误
java.io.IOException: All datanodes xxx.xxx.xxx.xxx:xxx are bad. Aborting…
at org.apache.hadoop.dfs.DFSClient$DFSOutputStream.processDatanodeError(DFSClient.java:2158)
at org.apache.hadoop.dfs.DFSClient$DFSOutputStream.access$1400(DFSClient.java:1735)
at org.apache.hadoop.dfs.DFSClient$DFSOutputStream$DataStreamer.run(DFSClient.java:1889)
java.io.IOException: Could not get block locations. Aborting…
at org.apache.hadoop.dfs.DFSClient$DFSOutputStream.processDatanodeError(DFSClient.java:2143)
at org.apache.hadoop.dfs.DFSClient$DFSOutputStream.access$1400(DFSClient.java:1735)
at org.apache.hadoop.dfs.DFSClient$DFSOutputStream$DataStreamer.run(DFSClient.java:1889)
经查明,问题原因是linux机器打开了过多的文件导致。用命令ulimit -n可以发现linux默认的文件打开数目为1024,修改/ect/security/limit.conf,增加hadoop soft 65535
再重新运行程序(最好所有的datanode都修改),问题解决
P.S:据说hadoop dfs不能管理总数超过100M个文件,有待查证
4 运行一段时间后hadoop不能stop-all.sh的问题,显示报错
no tasktracker to stop ,no datanode to stop
问题的原因是hadoop在stop的时候依据的是datanode上的mapred和dfs进程号。而默认的进程号保存在/tmp下,linux 默认会每隔一段时间(一般是一个月或者7天左右)去删除这个目录下的文件。因此删掉hadoop-hadoop-jobtracker.pid和 hadoop-hadoop-namenode.pid两个文件后,namenode自然就找不到datanode上的这两个进程了。
在配置文件中的export HADOOP_PID_DIR可以解决这个问题
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